神経眼科

[No.1507] 全血のRNAシーケンス解析に基づくAQP4抗体陽性視神経炎とMOG抗体陽性視神経炎の免疫学的メカニズムの違い

清澤のコメント：比較的少数のサンプル数ですが、全血のRNAシーケンス解析に基づくAQP4抗体陽性視神経炎とMOG抗体陽性視神経炎の免疫学的メカニズムの違いが論じられていて、AQP4-ON 患者では炎症性シグナル伝達が主に TLR2、TLR5、TLR8、TLR10 によって活性化され、MOG-ON 患者では主に TLR1、TLR2、TLR4、TLR5、TLR8 によって活性化されることが示されました。この結果から、MOG-ONでは、病原体関連分子パターン（PAMP）によって媒介される可能性が高いのに対し、AQP4-ON における炎症がダメージ関連分子パターン（DAMP）によって媒介される可能性が高いと結論しています。この論文の引用論文には、私も協力した日本からの視神経炎の集計の論文も含まれていました。
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全血のRNAシーケンス解析に基づくAQP4抗体陽性視神経炎とMOG抗体陽性視神経炎の免疫学的メカニズムの違い

目的 全血の RNA シーケンス (RNA-seq)に基づいて、アクアポリン 4 抗体関連視神経炎 (AQP4-ON) とミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質抗体関連視神経炎 (MOG-ON) の間の異なる免疫学的メカニズムを比較する。

方法 7 人の健康なボランティア、6 人の AQP4-ON 患者、8 人の MOG-ON 患者から全血を採取し、RNA-seq 分析に使用しました。 CIBERSORTxアルゴリズムを使用して免疫細胞浸潤の検査を行い、浸潤した免疫細胞を特定しました。 RNA-seq 解析の結果、AQP4-ON 患者では炎症性シグナル伝達が主に TLR2、TLR5、TLR8、TLR10 によって活性化され、MOG-ON 患者では主に TLR1、TLR2、TLR4、TLR5、TLR8 によって活性化されることが示されました。 遺伝子オントロジー (GO) 用語および遺伝子とゲノムの京都百科事典 (KEGG) 経路濃縮分析、および疾患オントロジー (DO) 分析に基づく示差的に発現する遺伝子 (DEG) の生物学的機能の同定は、MOG-ONでは、病原体関連分子パターン（PAMP）によって媒介される可能性が高いのに対し、AQP4-ON における炎症がダメージ関連分子パターン（DAMP）によって媒介される可能性が高い。 免疫細胞浸潤の分析は、免疫細胞浸潤の割合が患者の視力に関連していることを示しました。 単球 (rs = 0.69、P = 0.006) と M0 マクロファージ (rs = 0.66、P = 0.01) の浸潤率は BCVA (LogMAR) と正の相関があり、好中球の浸潤率は BCVA (LogMAR) と負の相関がありました。 ) (rs=0.65、P=0.01)。

結論 この研究は、患者の全血のトランスクリプトミクス分析に基づいて、AQP4-ON と MOG-ON の間の異なる免疫学的メカニズムを明らかにし、視神経炎に関する現在の知識を拡張する可能性があります。

注：全血のRNAシーケンス解析とは、

RNAシーケンスのメリット

次世代シーケンサー（NGS）によるRNA-Seqは、トランスクリプトームを研究する研究者にとって、ますます選択すべき手法となっています。遺伝子発現アレイと比較して、数多くの利点があります。

  • 幅広いダイナミックレンジで、より高感度かつ高精度な遺伝子発現測定が可能です
  • 予備知識なしで、 既知と新規の両方の特徴を捉えることができます
  • リファレンスシーケンスが入手できない場合でも、あらゆる生物種に適用可能です
  • 多くのアレイと比較して、サンプルあたりの価格が同等かそれ以下であるため、より高い価値を提供できます

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